L'Eremo delle Carceri è il luogo in cui San Francesco d'Assisi e i suoi seguaci si ritiravano per pregare e meditare. Situato a 4 Km da Assisi, alle pendici del Monte Subasio, l'Eremo sorge nei pressi di alcune grotte naturali, frequentate da eremiti già in età paleocristiana. Ampliato nel 1400 da San Bernardino da Siena con la costruzione della Chiesa di Santa Maria delle Carceri, che ha inglobato una primitiva cappella. Il Chiostrino dei Frati, una terrazza triangolare che si affaccia a strapiombo sul Fosso delle Carceri, conduce al refettorio dei frati e alla Chiesa. Al piano superiore del refettorio sono situate le celle dei frati. Scendendo una ripida scalinata, si arriva a un bosco di faggi e alla Grotta di San Francesco. Nel bosco di lecci, appena fuori dal Santuario, è sita la Cappella di San Barnaba. Sono molti i racconti di miracoli che si associano a questo sito.